上新 | 以科技之力守护生态，华大智造环境DNA宏条形码测序组合产品发布！
环境DNA测序技术是通过对环境介质（水、土壤、沉积物等）中的生物DNA进行测序，实现对生物群落的定性和丰度分析，并利用生物个体、种群或群落对环境变化所产生的反应来评估环境状况。环境DNA测序技术可应用于水、土壤和大气环境的监测，是评估生态环境状况和生物多样性的重要手段，也是环境科研领域的重要工具。
而高通量测序的灵敏度优势可以对环境中含量非常低的DNA实现检测。将高通量测序与eDNA序列相关联的技术称为“eDNA metabarcoding”（环境DNA宏条形码）。
华大智造基于DNBSEQ-G99和DNBSEQ-E25测序平台，现正式推出环境DNA宏条形码测序组合产品，以科技之力守护生态环境。该组合产品结合了DNBSEQ测序技术与ATOPlex多重PCR技术，搭配自主研发的自动化样本制备系统与分析软件，可覆盖从样本到分析结果全流程，实现环境DNA一站式监测。
华大智造独有的DNBSEQ测序技术，能够为eDNA的生信分析提供高质量的测序数据。ATOPlex多重PCR 技术，是华大智造自主研发的超高重 PCR 核心专利技术，可针对目标区域进行引物设计，并提供Panel和建库试剂等一整套方案，实现精准高效的环境DNA宏条形码测序。
覆盖从核酸提取到分析报告全流程，测序后自动触发分析，省心省力。
通过2步PCR在6小时内完成文库制备，可支持定制4608种Barcode，满足超高通量测序需求。
DNBSEQ-G99测序仪可在12小时内完成PE150测序，30小时内完成PE300测序，Q30＞85%。
监测物种涵盖细菌、真菌、藻类、植物、浮游动物、底栖动物和鱼类。
性能表现
按照华大智造环境DNA宏条形码测序组合产品的操作流程，采用根据已知物种构成和丰度的模拟样本S1-S3（含8种细菌DNA标准品的混合样本的3次重复），进行了重复性、物种检出率以及物种丰度定量准确性三方面的对比分析。分析结果如图1所示：预期物种全部检出，实测丰度与理论丰度接近，3次重复差异小。
应用案例
2023年6月，湖北省生态环境监测中心站在武汉东湖6个不同点位（D3-D8）采集水体样本，每个点位重复采样3次，基于MGI产品方案进行提取、建库、测序和分析，系统选取所有样本在种分类水平上丰度排名前18的物种识别结果并生成堆叠柱状图，结果如图2所示，可以看出，同一个点位的3次重复所检测的物种构成一样，6个点位共识别出59种鱼类。
为了分析不同点位之间物种多样性差异，系统可通过组间距离分析来评估不同样本之间的物种组成差异。结果如图3所示，横纵坐标均为样本，颜色反应横向和纵向样本间的距离。可以看出，D3和D8这2个点位在鱼类物种构成上有较高的相似性，而其他点位的样本之间的物种构成差异性比较大。